FIDUAGRARIA S.A. tiene un Sistema de Control Interno, integrado por el esquema de organización y el conjunto de los planes, métodos, principios, normas, procedimientos y mecanismos de verificación y evaluación adoptados por la entidad en procura de las metas u objetivos previstos. 

La Fiduciaria ha adoptado el modelo estándar de control interno MECI 1000:2005, de acuerdo a lo establecido por el decreto 1599 de 2005. Adicionalmente, se encuentra ajustando éste sistema de acuerdo a los requerimientos de la Circular Externa 014 de 2009, emitida por la Superintendencia Financiera de Colombia.Al interior de la fiduciaria existen los siguientes instrumentos de control:

COMITÉ DE AUDITORIA:
Creado para dar cumplimiento a lo dispuesto en la circular externa 052 de 1998 de la Superintendencia Bancaria (hoy Superintendencia Financiera), integrado por tres miembros de la Junta Directiva y responsable de servir de apoyo al órgano directivo en la toma de decisiones atinentes al control y mejoramiento de aquel.
 
COMITÉ DE COORDINACIÓN DE CONTROL INTERNO:
 
Creado en cumplimiento a lo dispuesto en la ley 87 de 1993 y esta conformado por la Presidencia y los Directivos que dependen directamente de ella.
Es el máximo rector del Sistema de Control Interno en la Fiduciaria, y esta encargado de establecer las políticas en materia de Control Interno al interior de la entidad y de examinar los informe sobre el cumplimiento del Plan de Mejoramiento suscrito con la Contraloría General de la República.
 
COMITÉ OPERATIVO DE MECI Y CALIDAD:
 
La circular N° 03 de 2005 del Consejo Asesor del Gobierno Nacional en materia de Control Interno de las entidades del Orden Nacional y Territorial, estableció la creación de un grupo operativo multidisciplinario, responsable de adelantar los proceso de diseño., apoyo y coordinación con las diferentes áreas de la entidad, para lograr una óptima implementación del MECI 1000:2005 y posteriormente asumir el rol de facilitadores apoyando el adecuado funcionamiento de los elementos de control y del sistema de gestión de calidad.
DIRECCIÓN DE CONTROL INTERNO:
 
Es uno de los elementos del Sistema de Control Interno de la entidad, responsable de evaluar mediante un proceso integral de auditoria, con objetividad e independencia, la efectividad del Sistema de Control Interno, la gestión empresarial y operacional de la fiduciaria, para verificar que se desarrollen dentro del marco legal, misión, políticas, normas y planes organizacionales que regulan su actividad, propendiendo por el desarrollo de la cultura de autocontrol. 

 Normatividad que rige a nuestra entidad:

Constitución política de 1991

Constitución Política de la República de Colombia. Artículos relacionados con las funciones de la Superintendencia Bancaria de Colombia.

Histórico de circulares de la Superintendencia Bancaria Archivo histórico de las Circulares Externas y Cartas Circulares expedidas por la Superintendencia Bancaria a partir del año 1998.

Estatuto Orgánico del Sistema Financiero
Normas relacionadas con las Sociedades Fiduciarias.

Leyes

Ley 795 de 2003 - Reforma Financiera
Ajusta algunas normas del Estatuto Orgánico del Sistema Financiero y se dictan otras disposiciones.

Ley 510 de 1999
Modifica el artículo 80 del Estatuto Orgánico del Sistema Financiero.

Ley 510 de 1999
Capital mínimo requerido para operar.

Ley 80 de 1993
Artículos sobre Fiducia Pública y de Contratación Estatal.

Ley 45 de 1990
Expide normas en materia de intermediación financiera, regula la actividad aseguradora y confiere algunas facultades.

Decretos

Decreto 2080 de 2000
Régimen General de Inversiones.

 Decreto 237 de 2000
Inversión obligatoria en TRD, para los fondos de inversión.

 Decreto 1797 de 1999
Establece niveles de patrimonio adecuados para las Sociedades Fiduciarias que administran patrimonios autónomos que tienen a su cargo la administración de reservas y garantía de obligaciones del Sistema de Seguridad Social.

 Decreto 315 de 1999
Calificación de títulos.

 Decreto 809 de 1998
Inversiones en sociedades dedicadas a estructurar emisiones de títulos.

 Decreto 810 de 1998
Patrimonios autónomos o encargos fiduciarios.

 Decreto 2805 de 1997
Contratos de red. 

Decreto 2346 de 1995
Inversiones de alta liquidez.

 Decreto 679 de 1994
Fiducia Pública.

 Decreto 847 de 1993
Solemnidad de los contratos de fiducia mercantil. 

Decreto 2239 de 1991
Contratos de red.

Otras normas

 Código del Comercio Título XI

Artículos sobre Sociedades Fiduciarias.

Resolución 4980 de 1987
Normas de carácter contable para las sociedades fiduciarias.